• Общие и правовые вопросы
• Деятельность филиалов
• Информационные системы

СОЛОВЬЕВ Александр Александрович - заместитель  директора, доктор биологических наук, профессор РАН
 
Курирует деятельность:

• Научного и методического обеспечения деятельности Россельхознадзора в области карантина растений
• Научного сотрудничества с национальными международными организациями в области карантина растений
• Проведения прикладных научных исследований
• Реализации образовательных программ повышения квалификации и дополнительных профессиональных программ
• Аспирантуры 

• Испытательного лабораторного центра
• Лабораторий филиалов учреждения

• Финансово-экономические подразделения 

КУРМАЕВ Артур Владимирович - заместитель директора

Курирует деятельность:

• Административно-хозяйственные подразделения

• Информационные технологии
• Информационную безопасность
• Развитие и поддержка информационных систем
• Цифровая трансформация